Гора Инаса (稲佐山, Инасаяма) — гора высотой 333 метра, расположенная недалеко от центра города Нагасаки. На вершину можно подняться по канатной дороге, на автобусе или автомобиле, и оттуда открываются великолепные виды на город. Фактически, ночные виды с горы Инаса входят в тройку лучших ночных видов Японии, наряду с видами с горы Хакодате и горы Рокко. На вершине расположены несколько теле- и радиоантенн, а также смотровая площадка с рестораном.

Сад Гловера (グラバー園, Glover-en) — музей под открытым небом в Нагасаки, в котором представлены особняки нескольких бывших иностранных жителей города и связанные с ними здания. Он расположен на холме, где поселились западные торговцы после окончания эпохи изоляции Японии во второй половине XIX века. Главной достопримечательностью сада является бывший дом Гловера, старейшее деревянное здание в западном стиле в Японии. Томас Гловер (1838-1911) был шотландским торговцем, который переехал в Нагасаки после открытия его порта для иностранной торговли в 1859 году. Позже он помогал некоторым революционерам, которые в конечном итоге свергли сёгунат Токугава во время Реставрации Мэйдзи. Работая в различных отраслях промышленности, включая судостроение и горнодобывающую промышленность, Гловер играет видную роль в ранней истории индустриализации Японии.

Храм Софукудзи (崇福寺, Sōfukuji) — храм в Нагасаки, принадлежащий школе Обаку дзен-буддизма. Первоначально построенный в 1629 году для китайских жителей Нагасаки, храм построен в китайском архитектурном стиле и несколько отличается от других храмов в Японии. Софукудзи построен вдоль склона холма. Внизу находятся двухэтажные входные ворота храма, Рюгумон (буквально: Ворота Дворца Дракона). Как и весь храм, они окрашены в ярко-красный цвет. Ворота были изначально построены в 1673 году, но несколько раз были разрушены пожаром и штормами, прежде чем последняя реконструкция была завершена в 1849 году.

Дэдзима (出島) был искусственным островом в порту Нагасаки, построенным в 1636 году для отделения португальских жителей от японского населения и контроля их миссионерской деятельности. Несколько лет спустя португальцы были изгнаны из Японии, а голландская торговая станция, ранее располагавшаяся в Хирадо, была перенесена в Дэдзиму. Голландцы были ограничены Дэдзимой в течение двух столетий изоляции Японии как единственные оставшиеся западные люди, которым было разрешено находиться в стране. Сегодня Дэдзима больше не является островом, так как окружающая территория была отвоевана в 20 веке. Однако ряд исторических сооружений Дэдзимы остались или были реконструированы в этом районе, включая различные резиденции, склады, стены и ворота. Конечная цель — превратить Дэдзиму обратно в остров, выкопав каналы вокруг всех четырех сторон.

Собор Ураками (浦上天主堂, Urakami Tenshudō) — католическая церковь в Нагасаки с трагической, но интересной историей. Сегодня это действующая церковь, расположенная в большом здании из красного кирпича в европейском стиле. В соборе хранятся различные реликвии, пережившие атомную бомбардировку. Атомная бомба была сброшена на Нагасаки 9 августа 1945 года и почти полностью уничтожила церковь, которая находилась всего в 500 метрах от эпицентра. Группа обугленных каменных святых осталась на месте и до сих пор стоит перед разрушенной стеной перед собором. Внутри также находятся другие реликвии, в том числе сохранившаяся голова статуи Святой Марии, извлеченная после взрыва, и один из оригинальных колоколов церкви. Современное воплощение собора было завершено в 1959 году.

Музей истории и культуры Нагасаки (長崎歴史文化博物館, Nagasaki Rekishi Bunka Hakubutsukan) — это хорошо выполненный современный музей, посвященный истории Нагасаки как одного из крупнейших международных торговых портов Японии. Довольно большая постоянная экспозиция занимает два этажа и состоит из различных секций, каждая из которых посвящена отдельному аспекту богатой истории Нагасаки. В период Эдо японское правительство приняло изоляционизм, фактически отрезав страну от остального мира. В это время Нагасаки стал одним из немногих портов, где была разрешена международная торговля, а именно с китайцами и голландцами. Это временно сделало город главным окном Японии во внешний мир и позволило процветать богатой экономике, культуре и истории.

Церковь Оура (大浦天主堂, Ōura Tenshudō) — католическая церковь в Нагасаки. Построенная в конце периода Эдо в 1864 году французским миссионером для растущего сообщества иностранных торговцев в городе, она считается старейшей действующей христианской церковью в Японии. Церковь Оура посвящена памяти 26 христиан, казненных в городе в 1597 году. Сегодня действующая церковь является привлекательным примером современной европейской архитектуры, привлекая множество посетителей. Церковь стала первым зданием в западном стиле в Японии, признанным национальным достоянием. Высокая плата за вход включает вход в музей об истории христианства в Японии.

Храм Кофукудзи (興福寺, Kōfukuji) — старейший и один из важнейших храмов, основанных китайцами в Нагасаки. Расположенный в районе Терамачи («Город храмов»), он является местом рождения школы Обаку дзен-буддизма в Японии и имеет много интересных особенностей. Храм был основан около 1620 года китайским монахом в то время, когда большое количество китайских торговцев приезжало в Нагасаки для торговли. Первоначально комплекс был создан как место для молитв о безопасном морском путешествии для торговцев, и на его конструкцию сильно повлияли китайские архитектурные стили, что делает его непохожим на другие храмы в Японии.

Храм Конфуция в Нагасаки (孔子廟, Kōshi-byō) — один из немногих храмов, посвященных почитаемому китайскому философу Конфуцию в Японии. Храм был построен в 1893 году китайской общиной Нагасаки. В красочном, атмосферном храме также есть музей в задней части территории. Небольшой сад с мостом и прудом встречает посетителей у входа. Богато украшенные здания в китайском стиле украшены желтыми крышами. По бокам двора храма стоят 72 мудреца, каменные статуи в натуральную величину, каждая из которых весит около двух тонн и изображает учеников Конфуция. Храм призывает посетителей найти среди статуй ту, которая напоминает родственника.

Памятник двадцати шести мученикам и прилегающий к нему музей (二十六聖人記念館, Nijūroku Seijin Kinenkan) в Нагасаки посвящены двадцати шести христианам, казненным здесь 5 февраля 1597 года. Среди них были как иностранные миссионеры, так и японские миряне. Миссионерская деятельность в то время была запрещена, и правитель Японии Тоётоми Хидэёси инсценировал казнь в качестве предупреждения. Памятник расположен в небольшом парке на холме недалеко от станции Нагасаки и предлагает прекрасный вид на город. Прямая красная линия проходит от памятника через площадь парка в направлении церкви Оура на противоположной стороне города. Церковь Оура также посвящена 26 мученикам.

Dutch Slope (オランダ坂, Oranda-zaka) — это мощеная камнем улица, ведущая вверх по склону холма в Нагасаки, где проживало много иностранных торговцев после открытия городского порта для иностранной торговли в 1859 году. Поскольку голландцы были единственными западными людьми, которым разрешалось находиться в стране в течение предыдущих двух столетий, «голландским» некоторое время называли все западное. Сегодня в этом районе сохранилось несколько бывших резиденций. Среди них Higashi Yamate 13, открытая для публики. Этот старый дом в западном стиле, когда-то принадлежавший состоятельной европейской семье, хорошо сохранился, сохранилась большая часть старой мебели и планировки комнат. Наверху есть балкон, с которого открывается прекрасный вид на окрестности. На первом этаже находится кафе.

Meganebashi (眼鏡橋, lit. Spectacles Bridge) is the most remarkable of several stone bridges that span the Nakashima River in downtown Nagasaki. The bridge, which gets its name from the resemblance it has to a pair of spectacles when reflected in the river water, is a popular tourist attraction and is designated as an important cultural property. The bridge was originally built in 1634, its construction overseen by the Chinese monk who would go on to become the resident priest of Kofukuji Temple, which is located a short walk away. The bridge, along with many of the others along the river, was badly damaged by floodwaters in 1982, but has since been repaired with recovered stones. There is a stone walkway along the river bank that makes for a pleasant stroll with nice views of the water and bridges. The walkway has a tranquil atmosphere and is accessed by steps from street level positioned at various points along the river

Художественный музей префектуры Нагасаки — это современный и просторный комплекс, красиво расположенный рядом с портом Нагасаки. Музей, спроектированный известным архитектором Кума Кенго, открылся в 2005 году и содержит постоянные коллекции произведений искусства, связанных с Нагасаки, а также большую коллекцию испанского искусства. Кроме того, здесь также проводятся временные выставки.

Парк мира Нагасаки (平和記念公園), построенный недалеко от эпицентра атомной бомбы, чтит память жертв бомбардировки 1945 года и пропагандирует всеобщий мир. Его центральная статуя мира символизирует надежду и память. В парке находятся международные памятники миру, Фонтан мира, а также он расположен недалеко от Музея атомной бомбы и парка эпицентра.

Музей атомной бомбы Нагасаки (長崎原爆資料館), расположенный недалеко от эпицентра бомбардировки 9 августа 1945 года, документирует разрушения, вызванные атомной бомбой, и историю восстановления города. В музее представлены такие артефакты, как расплавленные чётки, часы, остановившиеся в 11:02, и личные вещи жертв. Фотографии, свидетельства выживших и экспонаты музея передают ужасы ядерной войны и пропагандируют идеи мира. В музее есть аудиогиды, библиотека, видеозал и безбарьерный доступ. Музей служит ярким напоминанием о последствиях войны и острой необходимости ядерного разоружения и прочного мира во всём мире.