Mangrove Cay est un paradis pour la faune marine et ornithologique. Dans les chenaux et les eaux peu profondes qui l'entourent, il est fréquent d'apercevoir de jeunes requins citron et requins nourrices, de petites tortues, des conques, des raies pastenagues brunes, des étoiles de mer et de nombreuses espèces de poissons juvéniles. Les systèmes racinaires complexes et protecteurs des grands palétuviers cachent souvent des bancs de minuscules poissons. L'observation des oiseaux est également excellente : on peut y observer des pélicans bruns, des hérons verts, des hérons tricolores, des aigrettes roussâtres et des huîtriers d'Amérique.