Der Bau der Kirche geht auf das Jahr 690 n. Chr. zurück. Die erste Erwähnung der Kirche stammt aus dem Jahr 831 n. Chr. Patriarch Ibrahim baute die Kirche im Jahr 975 n. Chr. wieder auf und restaurierte sie. Im Laufe ihrer Geschichte wurde sie häufig restauriert. Die Antiquitäten, die nicht mehr verwendet werden können, wurden aufgrund ihrer historischen und archäologischen Bedeutung im koptischen Museum aufbewahrt.

Die St.-Georgs-Kirche ist eine griechisch-orthodoxe Kirche innerhalb der Babylonischen Festung im koptischen Kairo. Sie ist Teil des Heiligen Patriarchalischen Klosters St. Georg unter dem griechisch-orthodoxen Patriarchat von Alexandria und ganz Afrika. Die Kirche stammt aus dem 10. Jahrhundert (oder früher). Das heutige Gebäude wurde nach einem Brand im Jahr 1904 wiederaufgebaut und 1909 fertiggestellt.

Ursprünglich war sie Abu Kir und Yohanna (oder den Heiligen Cyrus und Johannes) gewidmet. Als die Überreste der Heiligen Barbara hierher gebracht wurden, wurde ein separates Heiligtum errichtet. Somit gibt es jetzt zwei separate Kirchen, die an dieser Stelle errichtet wurden. Athanasius, ein reicher Schreiber und Sekretär von Abdel-Aziz Ibn Marwan (Gouverneur von Ägypten zwischen 685 und 705 n. Chr.), hatte die Kirche erbaut. Eine Tür, die bei einer der vielen Restaurierungen der Kirche gefunden wurde, könnte aus dem 4. Jahrhundert stammen. Zwischen 1072 und 1073 wurde die Kirche vollständig restauriert, um die Reliquien der Heiligen Barbara aufzunehmen. Diese Reliquien sind bis heute erhalten. Die Kirche wurde im 12. Jahrhundert erneut durch einen Brand beschädigt. Die Kirche wurde zuletzt zwischen 1910 und 1922 umfassend renoviert, als der Khurus, ein Querraum vor dem Heiligtum, geopfert wurde, um mehr Platz zu schaffen.

Die Kirche der Heiligen Sergius und Bacchus wurde traditionell an der Stelle errichtet, an der die Heilige Familie, Josef, Maria und das Jesuskind, am Ende ihrer Reise nach Ägypten ruhten. Sie könnten hier gelebt haben, während Josef in der Festung arbeitete. Die Kirche ist von großer historischer Bedeutung und tatsächlich wurden hier viele Patriarchen der koptischen Kirche gewählt. Der erste, der hier gewählt wurde, war Patriarch Isaac (681-692). Es ist die Bischofskirche von Kairo und der Bischofssitz von Masr (der Bezirk von Alt-Kairo), der den früheren Bischofssitz von Babylon ersetzte. Viele Bischöfe des Bischofssitzes wurden bis zur Herrschaft von Patriarch Christodulus (1047–1077) in der Kirche geweiht.

Das Gründungsdatum der Ben-Esra-Synagoge ist nicht bekannt, obwohl es aus Dokumenten, die in der Geniza gefunden wurden, gute Belege dafür gibt, dass sie vor 882 n. Chr. entstand und wahrscheinlich vorislamisch ist. Im Jahr 882 verkaufte der Patriarch der koptisch-orthodoxen Kirche von Alexandria eine Kirche samt Grundstück an eine Gruppe von Juden, und einige Gelehrte des 19. Jahrhunderts haben angenommen, dass dies der Ursprung von Ben Esra war. Die Käufer waren jedoch Anhänger der Talmud-Akademien in Babylonien, und Ben Esra war eine Gemeinde, die die Lehren der rivalisierenden Talmud-Akademien in Syrien-Palästina befolgte. Moderne Gelehrte sind sich einig, dass der Grundstücksverkauf von 882 an eine rivalisierende Synagoge ging.

Das St. Simon-Kloster, auch bekannt als Höhlenkirche, liegt im Herzen des Mokattam-Bergs im Südosten Kairos und ist eine der größten Kirchen nicht nur in Ägypten, sondern im gesamten Nahen Osten. Die Höhlenkirche befindet sich in einem Gebiet, das als Zabbaleen-Stadt bekannt ist, was wörtlich „Müllstadt“ bedeutet. Diese Stadt hat die größte Anzahl an Müllsammlern und -recyclern in Kairo. Die Höhlenkirche wurde zum Gedenken an St. Simon erbaut, der gegen Ende des 10. Jahrhunderts während der Herrschaft des fatimidischen Kalifen Al-Mui’zz lebte. St. Simon war als Gerber tätig, ein bis heute bekanntes Handwerk.